《如懿传》中十二阿哥永基的结局是被乾隆皇帝厌弃，被迫离开皇宫，最终病逝。

十二阿哥永基是乾隆皇帝和继后那拉氏的儿子，但他并没有得到父亲的宠爱。相反，因为那拉氏和乾隆皇帝的矛盾冲突，永基也受到了牵连。虽然他贵为皇子，但实际上在宫中的处境十分艰难，不仅要面对其他皇子的排挤，还要应对乾隆皇帝的冷漠。

最终，因为一次事件，乾隆皇帝对永基彻底失望，将他逐出皇宫。永基离开皇宫后，生活困苦，最终因病去世。他的死因和去世的具体时间并没有在剧中明确交代，只是通过其他角色的对话暗示了他的离世。

永基的悲剧性结局让观众深感同情，他是宫廷权力斗争的牺牲品，也是父母矛盾的受害者。他的命运无法自己掌控，最终成为了宫廷斗争的牺牲品。这一结局也反映了宫廷生活的残酷和无情，让人们深感悲哀和无奈。